Берем чистую флешку отформатированную в FAT32 (или ext3).
Вставляем в USB порт Mikrotik.
Смотрим в разделе IP — Disks что флешка определилась, при необходимости форматируем. Форматирование уничтожит всю информацию на флешке.
В разделе Files должна отобразиться флешка.
Настраиваем параметры IP — SMB, не забываем про кнопки Shares и Users.